Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Clec18aQ7TSQ1 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms