Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm28775-201ENSMUST00000186918 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gpr68-203ENSMUST00000110066 3223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm26805-201ENSMUST00000181885 3089 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ctnna2-201ENSMUST00000075340 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap45-201ENSMUST00000043311 3499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms