Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms