Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms