Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Q3U6N9 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Q3U6N9 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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