Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Sec24aQ3U2P1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms