Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm14146-201ENSMUST00000155885 508 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Srsf6Q3TWW8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms