Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Samd11Q1RNF8 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Samd11Q1RNF8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Samd11Q1RNF8 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms