Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ttc39dQ0VF76 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ttc39dQ0VF76 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ttc39dQ0VF76 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ttc39dQ0VF76 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ttc39dQ0VF76 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ttc39dQ0VF76 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms