Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rundc1Q0VDN7 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.1 ms