Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms