Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
H3f3aP84244 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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