Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcr4P70658 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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