Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd13P70217 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms