Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rps29P62274 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms