Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tdrd6P61407 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms