Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtpreP49446 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtpreP49446 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtpreP49446 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtpreP49446 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtpreP49446 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PtpreP49446 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PtpreP49446 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PtpreP49446 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PtpreP49446 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtpreP49446 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms