Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Cldn8-201ENSMUST00000049697 2356 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Clec10a-202ENSMUST00000102571 1496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Aqp8-202ENSMUST00000098056 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm6298-201ENSMUST00000122262 981 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 E130114P18Rik-209ENSMUST00000186369 306 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm7384-201ENSMUST00000203682 530 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 CT025603.2-201ENSMUST00000224369 484 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Tmx2-202ENSMUST00000111664 1926 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Sult6b2-201ENSMUST00000111768 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm8603-201ENSMUST00000115649 1515 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm13542-201ENSMUST00000118484 637 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Taar7c-ps-201ENSMUST00000122123 1055 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm32591-201ENSMUST00000203038 414 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm5788-201ENSMUST00000220499 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm15283-202ENSMUST00000221427 818 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 AC126939.2-201ENSMUST00000225989 307 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm6684-201ENSMUST00000053717 685 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Olfr1419-201ENSMUST00000087857 1160 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Psme1-201ENSMUST00000089619 711 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Chd1P40201 Gm8391-201ENSMUST00000185632 726 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Chd1P40201 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Chd1P40201 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Slamf9-201ENSMUST00000027830 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Hdac9-203ENSMUST00000209667 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Mrgpra2b-201ENSMUST00000119798 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm13405-201ENSMUST00000146769 708 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Pcsk2os1-202ENSMUST00000156780 527 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 1700095A13Rik-201ENSMUST00000185460 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm31363-201ENSMUST00000199362 541 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm8171-201ENSMUST00000217443 720 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm9260-201ENSMUST00000199781 1380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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