Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm7251-201ENSMUST00000182661 1009 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm27241-201ENSMUST00000183517 622 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Phactr1-214ENSMUST00000149235 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtprkP35822 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm12529-201ENSMUST00000119529 268 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Apex1-201ENSMUST00000049411 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Serpina5-201ENSMUST00000021495 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 0610037L13Rik-203ENSMUST00000106726 515 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm11608-202ENSMUST00000153049 877 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Olfr1349-201ENSMUST00000051982 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm13197-201ENSMUST00000117204 225 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprkP35822 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms