Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxc11P31313 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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