Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Hbq1a-201ENSMUST00000020535 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Gm18471-201ENSMUST00000208272 452 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Cyp19a1-201ENSMUST00000034811 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Katnal2-211ENSMUST00000154665 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Gm9583-201ENSMUST00000219613 1843 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprmP28828 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprmP28828 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprmP28828 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprmP28828 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprmP28828 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprmP28828 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprmP28828 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtprmP28828 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtprmP28828 1810009J06Rik-201ENSMUST00000076638 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtprmP28828 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprmP28828 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprmP28828 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtprmP28828 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprmP28828 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtprmP28828 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtprmP28828 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprmP28828 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtprmP28828 1700108F19Rik-205ENSMUST00000190818 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprmP28828 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprmP28828 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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PtprmP28828 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 AC124173.1-201ENSMUST00000223701 189 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm13361-201ENSMUST00000119977 1431 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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