Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxd12P23812 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxd12P23812 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms