Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RarbP22605 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RarbP22605 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RarbP22605 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RarbP22605 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RarbP22605 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RarbP22605 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RarbP22605 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RarbP22605 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RarbP22605 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RarbP22605 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RarbP22605 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RarbP22605 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RarbP22605 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RarbP22605 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RarbP22605 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RarbP22605 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RarbP22605 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RarbP22605 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RarbP22605 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RarbP22605 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RarbP22605 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RarbP22605 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RarbP22605 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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