Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms