Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Calb1P12658 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms