Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc1a6O35544 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms