Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srp72F8VQC1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms