Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Tdrkh-203ENSMUST00000196386 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm13197-201ENSMUST00000117204 225 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 A630023P12Rik-203ENSMUST00000141532 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 0610037L13Rik-203ENSMUST00000106726 515 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Htr1b-201ENSMUST00000051005 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms