Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6880A3KG45 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms