Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms