Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lgr5Q9Z1P4 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Lgr5Q9Z1P4 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lgr5Q9Z1P4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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