Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm15071-201ENSMUST00000118189 1366 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm22906-201ENSMUST00000175191 250 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrfQ9JM73 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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