Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rabgef1Q9JM13 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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