Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Smg9Q9DB90 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Smg9Q9DB90 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Smg9Q9DB90 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Smg9Q9DB90 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Smg9Q9DB90 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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