Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms