Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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