Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TgdsQ8VDR7 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms