Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Card11Q8CIS0 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Card11Q8CIS0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms