Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms