Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc28aQ8CEI3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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