Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RybpQ8CCI5 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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