Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms