Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Htatsf1Q8BGC0 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Htatsf1Q8BGC0 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms