Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc50Q810U5 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Scfd2-208ENSMUST00000151474 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Psat1-201ENSMUST00000025542 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc50Q810U5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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