Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccdc88cQ6VGS5 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccdc88cQ6VGS5 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccdc88cQ6VGS5 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccdc88cQ6VGS5 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccdc88cQ6VGS5 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ccdc88cQ6VGS5 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ccdc88cQ6VGS5 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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