Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clcn1Q64347 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms