Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Tubd1-205ENSMUST00000167178 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ccnt1-201ENSMUST00000012104 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm21276-201ENSMUST00000179666 2626 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cpsf3-201ENSMUST00000067284 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Sfi1-201ENSMUST00000066391 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sft2d1Q5SSN7 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms