Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
R3hdm4Q4VBF2 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms