Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Usp30Q3UN04 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Usp30Q3UN04 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Usp30Q3UN04 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Usp30Q3UN04 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Usp30Q3UN04 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Usp30Q3UN04 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Usp30Q3UN04 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Usp30Q3UN04 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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