Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Srsf6Q3TWW8 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms